Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YPL276WYPL276W 438 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 snR191snR191 274 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 ATG13YPR185W 2217 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 CWC22YGR278W 1734 nt3.13□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 DIE2YGR227W 1578 nt3.12□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 NOP19YGR251W 591 nt3.12□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 TIM18YOR297C 579 nt3.12□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 TOM1YDR457W 9807 nt3.12□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 CYR1YJL005W 6081 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YKL083WYKL083W 615 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 SLM6YBR266C 453 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YJR003CYJR003C 1560 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 MDM32YOR147W 1869 nt3.11□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 POM152YMR129W 4014 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YPL150WYPL150W 2706 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YDR102CYDR102C 333 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 ATP3YBR039W 936 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 SWT1YOR166C 1377 nt3.1□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 SNX41YDR425W 1878 nt3.09□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 SLH1YGR271W 5904 nt3.09□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 TIM11YDR322C-A 291 nt3.09□□□□□ -1.91
CLF1Q12309 PDR3YBL005W 2931 nt3.09□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 RPO41YFL036W 4056 nt3.09□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 KIN82YCR091W 2163 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 snR65snR65 100 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YDR209CYDR209C 414 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YFL032WYFL032W 321 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 AAD16YFL057C 459 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 RPL37AYLR185W 267 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 ATP15YPL271W 189 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 TRM2YKR056W 1920 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 DBP7YKR024C 2229 nt3.08□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 NAB6YML117W 3405 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YER138CYER138C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YER160CYER160C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YJR027WYJR027W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YML039WYML039W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YML045WYML045W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YMR050CYMR050C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 TFC4YGR047C 3078 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SRB8YCR081W 4284 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 snR70snR70 164 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 ATP17YDR377W 306 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YJL202CYJL202C 348 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YKL111CYKL111C 336 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 RPS22BYLR367W 393 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SEC26YDR238C 2922 nt3.07□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SGS1YMR190C 4344 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SLN1YIL147C 3663 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 TIM8YJR135W-A 264 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 APC2YLR127C 2562 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 BNA4YBL098W 1383 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YPL238CYPL238C 390 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 FUS1YCL027W 1539 nt3.06□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 ESL2YKR096W 3588 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 TSA2YDR453C 591 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YEL057CYEL057C 702 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YMR31YFR049W 372 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 PAU14YIL176C 363 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 PAU1YJL223C 363 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YAR029WYAR029W 225 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YLR278CYLR278C 4026 nt3.05□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SPB1YCL054W 2526 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 ESC1YMR219W 4977 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 snR8snR8 190 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 TIF35YDR429C 825 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 ISU1YPL135W 498 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 ESL1YIL151C 3357 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 PTP3YER075C 2787 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 DUG2YBR281C 2637 nt3.04□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 YDR239CYDR239C 2364 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 FKS3YMR306W 5358 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SAP1YER047C 2694 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 GIN4YDR507C 3429 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 URM1YIL008W 300 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 JIP3YLR331C 378 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 GEA1YJR031C 4227 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 NDD1YOR372C 1665 nt3.03□□□□□ -1.92
CLF1Q12309 SIP3YNL257C 3690 nt3.03□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 snR36snR36 182 nt3.02□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 MOT1YPL082C 5604 nt3.02□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 OST1YJL002C 1431 nt3.02□□□□□ -1.93
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