Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 YLR379WYLR379W 375 nt1.84□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.84□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 NAN1YPL126W 2691 nt1.84□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 RRP6YOR001W 2202 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YFR056CYFR056C 369 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 VMA21YGR105W 234 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YIR020CYIR020C 303 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 RAM2YKL019W 951 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 ARV1YLR242C 966 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YHC1YLR298C 696 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 SWS2YNL081C 432 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 LSM7YNL147W 348 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 ATP15YPL271W 189 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 SSY1YDR160W 2559 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 LEU3YLR451W 2661 nt1.83□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YLR458WYLR458W 381 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 SIP18YMR175W 240 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 RBL2YOR265W 321 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YPR096CYPR096C 303 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 MYO2YOR326W 4725 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 VPS15YBR097W 4365 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 UBP11YKR098C 2154 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 AFR1YDR085C 1863 nt1.82□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 OCA6YDR067C 675 nt1.81□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.81□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 BRP1YGL007W 378 nt1.81□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 CCW14YLR390W-A 717 nt1.81□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 LAG1YHL003C 1236 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 TPM2YIL138C 486 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 IST3YIR005W 447 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 ATP7YKL016C 525 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YNR025CYNR025C 360 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 SSF1YHR066W 1362 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 VPH1YOR270C 2523 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 IRC10YOL015W 1761 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 MET18YIL128W 3099 nt1.8□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 VPS34YLR240W 2628 nt1.79□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 GYP5YPL249C 2685 nt1.79□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YDL016CYDL016C 303 nt1.79□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 LRP1YHR081W 555 nt1.79□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 MGR1YCL044C 1254 nt1.79□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 DPB11YJL090C 2295 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 CAT2YML042W 2013 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 BFA1YJR053W 1725 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 NOP10YHR072W-A 177 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 SNC1YAL030W 354 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 GMC2YLR445W 567 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 YPL080CYPL080C 327 nt1.78□□□□□ -2.12
VIK1Q12045 BRO1YPL084W 2535 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YDR029WYDR029W 315 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 FMP16YDR070C 282 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 CHZ1YER030W 462 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 RPS7BYNL096C 573 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 SSQ1YLR369W 1974 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 BI4Q0120 1917 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 LHS1YKL073W 2646 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 FAB1YFR019W 6837 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 TRL1YJL087C 2484 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 PTC5YOR090C 1719 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 HER1YOR227W 3741 nt1.77□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 PKH3YDR466W 2697 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 PEA2YER149C 1263 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YGL015CYGL015C 393 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 CMS1YLR003C 876 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YLR031WYLR031W 561 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 ATG38YLR211C 681 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YLR252WYLR252W 306 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YLR271WYLR271W 825 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 ICY1YMR195W 384 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YOR105WYOR105W 327 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YJL070CYJL070C 2667 nt1.76□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 SPO22YIL073C 2928 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 HCS1YKL017C 2052 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 NCL1YBL024W 2055 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 SMD1YGR074W 441 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YIL029CYIL029C 429 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 BUD19YJL188C 309 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 URA10YMR271C 684 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YPR172WYPR172W 603 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 PEP1YBL017C 4740 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 CHC1YGL206C 4962 nt1.75□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 HSH155YMR288W 2916 nt1.74□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 EMP24YGL200C 612 nt1.74□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 RNR4YGR180C 1038 nt1.74□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 YML084WYML084W 309 nt1.74□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 RPB11YOL005C 363 nt1.74□□□□□ -2.13
VIK1Q12045 TOA1YOR194C 861 nt1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms