Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBRQ0VD83 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms