Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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