Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN5Q08AF3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN5Q08AF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms