Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms