Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN3Q08043 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms