Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms