Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms