Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL16A1Q07092 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms