Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR3Q06889 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms