Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FMODQ06828 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FMODQ06828 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FMODQ06828 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FMODQ06828 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms