Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG1Q06432 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms