Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCDQ05655 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms