Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN1Q05586 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms