Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms