Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRB3Q04118 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms