Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A11Q02978 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms