Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms