Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP4Q02446 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP4Q02446 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SP4Q02446 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms