Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms