Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FLI1Q01543 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms