Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN7AQ01118 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms