Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F1Q01094 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms