Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1BQ00975 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms