Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG6Q00889 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSG6Q00889 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG6Q00889 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG6Q00889 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSG6Q00889 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSG6Q00889 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms