Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms