Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms