Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM193AP78312 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms