Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms