Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA2P62736 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms