Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNRPD2P62316 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms