Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMO4P61968 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms