Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRP54P61011 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRP54P61011 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP54P61011 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP54P61011 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP54P61011 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP54P61011 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms