Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms