Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms