Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA1P56159 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms