Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP9P55211 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP9P55211 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP9P55211 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP9P55211 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms