Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MANFP55145 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MANFP55145 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MANFP55145 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MANFP55145 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MANFP55145 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MANFP55145 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MANFP55145 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MANFP55145 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms