Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms