Protein–RNA interactions for Protein: P53306

GPI1, Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit GPI1, yeastyeast

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GPI1P53306 RPL36AYMR194W 303 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 COQ10YOL008W 624 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YBR032WYBR032W 303 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 TSC3YBR058C-A 243 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YPL276WYPL276W 438 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YBR197CYBR197C 654 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SLM6YBR266C 453 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SNX41YDR425W 1878 nt2.33□□□□□ -2.04
GPI1P53306 BRO1YPL084W 2535 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 GCV2YMR189W 3105 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YCR064CYCR064C 411 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YER079WYER079W 633 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YLR458WYLR458W 381 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 PEX17YNL214W 600 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YOR105WYOR105W 327 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YPR012WYPR012W 255 nt2.32□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 AAD16YFL057C 459 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RRF1YHR038W 693 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RPL40AYIL148W 387 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 IRC19YLL033W 693 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 PDR11YIL013C 4236 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RLI1YDR091C 1827 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SSN2YDR443C 4263 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SDC25YLL016W 3147 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 VPS13YLL040C 9435 nt2.31□□□□□ -2.04
GPI1P53306 PHO91YNR013C 2685 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SIR3YLR442C 2937 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YGR025WYGR025W 303 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 NCE101YJL205C 162 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RAM2YKL019W 951 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RNP1YLL046C 750 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 COA4YLR218C 453 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 CCW14YLR390W-A 717 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 AIM32YML050W 936 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 snR13snR13 124 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YPR039WYPR039W 336 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 MGR1YCL044C 1254 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YPK1YKL126W 2043 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 BAS1YKR099W 2436 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RGA2YDR379W 3030 nt2.3□□□□□ -2.04
GPI1P53306 NUP82YJL061W 2142 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 OSW7YFR039C 1533 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YDR269CYDR269C 324 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YAR068WYAR068W 486 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YLR334CYLR334C 381 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YOL134CYOL134C 390 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YOL159CYOL159C 516 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 ATP3YBR039W 936 nt2.29□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SGS1YMR190C 4344 nt2.28□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YJL181WYJL181W 1836 nt2.28□□□□□ -2.04
GPI1P53306 MSB1YOR188W 3414 nt2.28□□□□□ -2.04
GPI1P53306 DNF1YER166W 4716 nt2.28□□□□□ -2.04
GPI1P53306 YHR138CYHR138C 345 nt2.28□□□□□ -2.04
GPI1P53306 RPS1AYLR441C 768 nt2.28□□□□□ -2.04
GPI1P53306 SCD5YOR329C 2619 nt2.27□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YDL068WYDL068W 330 nt2.27□□□□□ -2.05
GPI1P53306 Q0142Q0142 177 nt2.27□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YJL202CYJL202C 348 nt2.27□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YLR031WYLR031W 561 nt2.27□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.27□□□□□ -2.05
GPI1P53306 PRP6YBR055C 2700 nt2.26□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YPR089WYPR089W 2667 nt2.26□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YJL016WYJL016W 1686 nt2.26□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YML084WYML084W 309 nt2.26□□□□□ -2.05
GPI1P53306 COX7YMR256C 183 nt2.26□□□□□ -2.05
GPI1P53306 IRA2YOL081W 9240 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 NIC96YFR002W 2520 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 ATP17YDR377W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 PET191YJR034W 327 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 ZEO1YOL109W 342 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 RPS12YOR369C 432 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 DAD3YBR233W-A 285 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 CSF1YLR087C 8877 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 PES4YFR023W 1836 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 VPS52YDR484W 1926 nt2.25□□□□□ -2.05
GPI1P53306 KRE33YNL132W 3171 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 FAR11YNL127W 2862 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 KSP1YHR082C 3090 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 HRD3YLR207W 2502 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 SWF1YDR126W 1011 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.24□□□□□ -2.05
GPI1P53306 NFU1YKL040C 771 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms