Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP98P52948 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP98P52948 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP98P52948 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP98P52948 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP98P52948 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP98P52948 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP98P52948 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms