Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms