Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX2P50458 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX2P50458 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX2P50458 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX2P50458 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX2P50458 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX2P50458 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms