Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM4P49221 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms