Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIP4K2AP48426 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms