Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME1P48163 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME1P48163 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME1P48163 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME1P48163 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME1P48163 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME1P48163 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME1P48163 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME1P48163 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms