Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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