Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms