Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFMP43652 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFMP43652 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFMP43652 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFMP43652 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFMP43652 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFMP43652 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFMP43652 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFMP43652 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFMP43652 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFMP43652 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFMP43652 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFMP43652 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms